{"id":3239,"date":"2021-01-04T15:15:09","date_gmt":"2021-01-04T14:15:09","guid":{"rendered":"https:\/\/www.lvbe.uha.fr\/?page_id=3239"},"modified":"2022-03-10T10:06:18","modified_gmt":"2022-03-10T09:06:18","slug":"dr-clement-labois","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.lvbe.uha.fr\/index.php\/equipe\/docteurs-es-sciences-formes-au-lvbe\/dr-clement-labois\/","title":{"rendered":"Dr. Cl\u00e9ment LABOIS"},"content":{"rendered":"<h2>\u00c9tude des r\u00e9ponses de d\u00e9fense de <em>Vitis vinifera subsp. sylvestris<\/em> et de facteurs d\u2019agressivit\u00e9 des champignons dans le cadre des maladies du bois de la vigne.<\/h2>\n<p>Soutenue \u00a0le 22 d\u00e9cembre 2020, en visioconf\u00e9rence pour cause de crise sanitaire.<\/p>\n<p>Directeur de th\u00e8se : Pr. Julie Chong, Universit\u00e9 de Haute Alsace<\/p>\n<p>Co-directeur de th\u00e8se : Dr. Mary-Lor\u00e8ne GODDARD Ing\u00e9nieure de recherche, Universit\u00e9 de Haute Alsace<\/p>\n<p>R\u00e9sum\u00e9 :<\/p>\n<p>Ces derni\u00e8res ann\u00e9es, les vignobles de France et du monde sont confront\u00e9s \u00e0 la recrudescence des maladies du bois (MDB) de la vigne. Ces maladies sont \u00e0 la fois \u00e0 l\u2019origine de pertes de rendement, de qualit\u00e9 mais elles sont surtout responsables d\u2019une mortalit\u00e9 importante des ceps. Parmi ces MDB, trois principales ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9es : l\u2019esca (associ\u00e9e \u00e0 un complexe de champignons dont <em>Fomitiporia mediterraneae<\/em>, <em>Phaeoacremonium minimum<\/em> et <em>Phaemoniella chlamydospora<\/em>), l\u2019eutypiose (caus\u00e9e par <em>Eutypa lata<\/em>) et le d\u00e9p\u00e9rissement \u00e0 <em>Botryosphaeriaceae<\/em> (associ\u00e9e aux <em>Botryosphaeriaceae<\/em> subsp. dont <em>Neofusicoccum parvum<\/em> (<em>N. parvum<\/em>) et <em>Diplodia seriata <\/em>(<em>D. seriata<\/em>)). Malheureusement, \u00e0 ce jour, il n\u2019existe aucun traitement efficace pour limiter, prot\u00e9ger et pr\u00e9venir ces maladies. Il a \u00e9t\u00e9 montr\u00e9 au laboratoire que la vigne sauvage (<em>sylvestris)<\/em> \u00e9tait moins sensible aux MDB par rapport \u00e0 la vigne cultiv\u00e9e (<em>vinifera<\/em>). Afin de comprendre les diff\u00e9rences de tol\u00e9rances observ\u00e9es entre la vigne sauvage et la vigne cultiv\u00e9e, nous avons \u00e9tudi\u00e9 la variation du m\u00e9tabolisme primaire et sp\u00e9cialis\u00e9 par des techniques d\u2019HLPC-MS et de GC-MS. Nous avons \u00e9galement \u00e9tudi\u00e9 l\u2019activation de g\u00e8nes de d\u00e9fense en r\u00e9ponse \u00e0 l\u2019infection caus\u00e9e par <em>N. parvum<\/em> apr\u00e8s inoculation de sarments d\u00e9tach\u00e9s par une \u00e9tude transcriptomique. Parall\u00e8lement \u00e0 ces travaux, nous nous sommes int\u00e9ress\u00e9s aux m\u00e9canismes de d\u00e9toxification des stilb\u00e8nes par l\u2019arsenal enzymatique des champignons <em>N. parvum <\/em>et <em>D. seriata<\/em>.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Nos r\u00e9sultats montrent que l\u2019inoculation de <em>N. parvum<\/em> a d\u00e9clench\u00e9 des changements importants dans les m\u00e9tabolismes primaires et sp\u00e9cialis\u00e9s du bois ainsi qu&rsquo;une expression diff\u00e9rentielle des g\u00e8nes de d\u00e9fense. Chez les deux sous-esp\u00e8ces, l&rsquo;infection a entra\u00een\u00e9 une forte diminution des sucres (fructose, glucose, saccharose), tandis que la teneur en sucre alcool (mannitol et arabitol) a augment\u00e9. En ce qui concerne les acides amin\u00e9s, l&rsquo;infection pr\u00e9coce par <em>N. parvum<\/em> a d\u00e9clench\u00e9 une diminution de l&rsquo;acide aspartique, de la s\u00e9rine et de l&rsquo;asparagine, et une forte augmentation de l&rsquo;alanine et \u03b2-alanine. Nous avons pu observer une alt\u00e9ration plus rapide et plus intense des teneurs en m\u00e9tabolites primaires chez la vigne sauvage en r\u00e9ponse \u00e0 l\u2019infection par rapport \u00e0 la vigne cultiv\u00e9e. La teneur en resv\u00e9ratrol et en plusieurs oligom\u00e8res du resv\u00e9ratrol a augment\u00e9 dans le bois des deux sous-esp\u00e8ces apr\u00e8s l&rsquo;infection. Nous avons \u00e9galement pu observer une augmentation de l&rsquo;expression de plusieurs g\u00e8nes dont la <em>STS<\/em>, la <em>PPO<\/em> et plusieurs GTS. Nous avons \u00e9galement observ\u00e9 une diminution de l&rsquo;expression de g\u00e8nes codant pour la biosynth\u00e8se et la perception de l&rsquo;\u00e9thyl\u00e8ne. Il semblerait que la meilleure tol\u00e9rance de <em>sylvestris <\/em>aux MDB de la vigne vienne du fait que cette sous-esp\u00e8ce serait capable d&rsquo;initier plus fortement l&rsquo;induction ou la r\u00e9pression de certains g\u00e8nes de d\u00e9fense, lui conf\u00e9rant ainsi une meilleure d\u00e9fense vis-\u00e0-vis des MDB. De plus, nous avons \u00e9galement montr\u00e9 que <em>D. seriata <\/em>et <em>N. parvum<\/em> \u00e9taient capables de m\u00e9taboliser efficacement des formes monom\u00e9riques de stilb\u00e8nes (resv\u00e9ratrol, pic\u00e9ide et pic\u00e9atannol) au profit &#8211; et de mani\u00e8re surprenante &#8211; des formes dim\u00e9riques de stilb\u00e8nes (notamment la \u03b4-vinif\u00e9rine pourtant toxique pour les champignons) par l\u2019interm\u00e9diaire d\u2019enzymes extracellulaires.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>En conclusion, notre travail montre une sp\u00e9cificit\u00e9 de r\u00e9ponse de la vigne sauvage par rapport \u00e0 la vigne cultiv\u00e9e au regard de la modification du m\u00e9tabolisme primaire et sp\u00e9cialis\u00e9. Nos r\u00e9sultats montrent \u00e9galement la capacit\u00e9 de d\u00e9toxification des stilb\u00e8nes par les enzymes extracellulaires des champignons. Ces r\u00e9sultats pourraient expliquer \u00e0 la fois la diff\u00e9rence de sensibilit\u00e9 aux MDBs observ\u00e9es entre la vigne sauvage et la vigne cultiv\u00e9e mais \u00e9galement comment les champignons arrivent \u00e0 passer au travers des d\u00e9fenses mises en place par la vigne.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>\u00c9tude des r\u00e9ponses de d\u00e9fense de Vitis vinifera subsp. sylvestris et de facteurs d\u2019agressivit\u00e9 des champignons dans le cadre des maladies du bois de la vigne. Soutenue \u00a0le 22 d\u00e9cembre 2020, en visioconf\u00e9rence pour cause de crise sanitaire. Directeur de th\u00e8se : Pr. 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