Sous la direction de Bernard WALTER et
Co-encadr\u00e9 par Paul Schellenbaum
Th\u00e8se soutenue en septembre 2014<\/p>\n
La vigne est l’une des productions fruiti\u00e8res les plus importantes sur le plan \u00e9conomique dans le monde. Elle peut \u00eatre consomm\u00e9e sous forme de fruit frais (raisin de table), fruit secs (raisin sec) ou boisson (jus, spiritueux et vin). La plupart des vari\u00e9t\u00e9s de vigne appartiennent \u00e0 l’esp\u00e8ce europ\u00e9enne Vitis vinifera, destin\u00e9es \u00e0 la production de vins de grande qualit\u00e9.<\/p>\n
Pour l’identification des cultivars de Vitis vinifera des marqueurs mol\u00e9culaires ont \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9s comme les SSRs (\u00absimple sequence repeats\u00bb) ou les AFLPs (\u00abamplified fragment length polymorphisms\u00bb). La variation \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique en tant que source de diversit\u00e9 est \u00e0 l\u2019\u00e9tude dans plusieurs esp\u00e8ces v\u00e9g\u00e9tales. Chez la vigne, les marqueurs MSAP (\u00abmethylation-sensitive amplified polymorphism\u00bb) ont permis la d\u00e9tection de distinguer des somaclones entre eux et de leurs clones-m\u00e8res (Schellenbaum et al, 2008).<\/p>\n
Dans notre \u00e9tude, un ensemble de clones Vitis vinifera cv Pinot Noir ont \u00e9t\u00e9 analys\u00e9s en utilisant la technique MSAP, g\u00e9n\u00e9rant deux cat\u00e9gories de fragments polymorphes, certains \u00abstables\u00bb et d\u2019autres \u00abinstables\u00bb. Seuls les polymorphismes stables ont servi \u00e0 la distinction robuste de 92,5 % des clones \u00e9tudi\u00e9s (Oca\u00f1a et al, 2013). Dix fragments polymorphes stables ont \u00e9t\u00e9 isol\u00e9s et s\u00e9quenc\u00e9s. Apr\u00e8s traitement au bisulfite et amplification des fragments, les profils de m\u00e9thylation de cytosine de quatre s\u00e9quences converties ont \u00e9t\u00e9 compar\u00e9s pour 40 clones de Pinot noir. Les r\u00e9sultats montrent que des marqueurs SNP (\u00ab\u00a0single-nucleotide polymorphisms\u00a0\u00bb) sont absents dans ces s\u00e9quences converties et que la plupart des cytosines m\u00e9thyl\u00e9es se retrouvent dans un contexte CG.<\/p>\n
Les marqueurs MSAP stables pourraient \u00eatre utiles pour exploiter les diff\u00e9rences \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques dans des populations clonales et pour accroitre la variabilit\u00e9 de la vigne. Ils permettraient alors de d\u00e9velopper des profils de m\u00e9thylation de la cytosine sp\u00e9cifiques, et d\u2019\u00e9tablir la distinction de clones ph\u00e9notypiquement identiques. En outre, l’approche MSAP pourrait \u00eatre utile pour \u00e9tudier les origines clonales du Pinot noir en se basant sur les profils de m\u00e9thylation des clones. Enfin, la caract\u00e9risation des clones avec des profils de m\u00e9thylation de cytosine sp\u00e9cifiques dans plusieurs zones g\u00e9ographiques pourrait permettre l’\u00e9tude de l’adaptation de la vigne aux changements environnementaux et aux pratiques agricoles.<\/p>\n
R\u00e9f\u00e9rences :
Oca\u00f1a, J., Walter, B., & Schellenbaum, P. (2013) Stable MSAP Markers for the Distinction of Vitis vinifera cv Pinot Noir Clones. Molecular Biotechnology, 55:236\u2013248.
\nSchellenbaum, P., Mohler, V., Wenzel, G., & Walter, B. (2008). Variation in DNA methylation patterns of grapevine somaclones (Vitis vinifera L.). BMC Plant Biology, 8:78.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Diversit\u00e9 \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique de clones et de somaclones de vigne (Vitis vinifera L.)\u00a0: mise en \u00e9vidence de marqueurs MSAP stables et instables. Sous la direction de Bernard WALTER etCo-encadr\u00e9 par Paul SchellenbaumTh\u00e8se soutenue en septembre 2014 La vigne est l’une des productions fruiti\u00e8res les plus importantes sur le plan \u00e9conomique dans le monde. Elle peut \u00eatre […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":1763,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-102","page","type-page","status-publish","hentry"],"yoast_head":"\n